Il a rendu tellement de services aux Lions Indomptables du Cameroun et a traversé, avec cette sélection nationale, les creux de vagues, comme des temps forts. Sélectionné pour la première fois en Lions Indomptables en mai 2009, il n’a que dix-huit ans lorsqu’il représente son pays à la Coupe du Monde 2010 en Afrique du Sud. Il va souffrir pendant longtemps de la comparaison avec Samuel Eto’o aux yeux des Camerounais même si en club, il aura régulièrement inscrit des buts.
Parlant de but, l’un des plus mémorables demeure celui inscrit en finale de la CAN 2017 contre l’Égypte et qui offrira le cinquième trophée de Champion d’Afrique au Cameroun.
C’est un centre de Kunde Malong qui trouve Aboubakar d’abord pour l’amorti, avant de finir tranquillement d’une frappe imparable. La ligne pour l’histoire a ainsi été écrite.
